乌鲁木齐碾子沟客运站二类口岸
乌鲁木齐碾子沟客运站口岸位于乌市黑龙江路新疆旅客运输公司院内，东邻“长征”小商品批发市场，南连火车站和商贸城。1994年5月获准成立碾子沟二类口岸。目前，碾子沟二类口岸建有海关监管仓库2894平方米，共有40间库房，停车场面积达13160平方米，是国际汽车旅客、行包、零担货物联运的集散地，设有涉外售票窗口、国际 行包托运处和查验专场地等办公场所。1999年至今该二类口岸出口货物约70364吨，进口货物约40吨，发出中哈双方客车往返班次732班，承运旅客约7300人次，货车班次2960班。

边疆宾馆二类口岸
边疆二类口岸于 1997年经自治区人民政府批准设立。边疆宾馆市场主要以经营服装、家用电器、食品等轻工产品为主。该口岸现有对外贸易铺位800多间，设立三个监管库区，占地4万平方米，建监管库房200多间，并在监管区安装了闭路电视监控系统，可对库区进行24小时监控。边疆二类口岸为旅游购物开设了市场部、劳务仓储部、保安部，形成了购物、食宿、仓储、报关报验、装运为一体的服务机制。99年，从边疆二类口岸发出直达车和倒短车约8000车次，货物约16万吨，价值约30亿人民币。边疆二类口岸已成为乌鲁木齐较大的旅游购物市场。

乌鲁木齐经济技术开发区二类口岸
乌鲁木齐经济技术开发区口岸于1997年经自治区人民政府批准设立，1998年8月30日正式开放。口岸位于经济技术开发区内，距亚欧大陆桥西北国际列车编组站(乌鲁木齐西站)3公里，紧邻乌鲁木齐国际机场。目前，该二类口岸共有海关监管仓库50余间，停车场1万多平方米，监管区安装了监视系统，实行全方位监控。查验单位在口岸实行定人定岗联合办公，并设立了乌鲁木齐涉外运输中心调度站。为方便中外客商旅游购物，建有4个大型国际贸易旅游购物市场，营业面积5万平方米。自该口岸开放以来，累计过货6282吨，货值1533万美元。

乌鲁木齐商贸城二类口岸
乌鲁木齐商贸城口岸依托新疆商贸城，于1998年经自治区人民政府批准开放。口岸区有监管库区2000多平方米，99年发往周边国家货车600多辆次，运出货物16000多吨，货值1亿多元人民币。新疆商贸城是一座较大的综合批发市场，大部分商品为低价的日常用品，现已形成一定规模，经营品种受到国内外客商欢迎。

华凌市场二类口岸
华凌市场口岸于1998年11月26日正式开放。位于乌鲁木齐市中腹地带，南接西虹路、西连河滩高速公路的华凌市场内。二类口岸占地6389平方米，库房面积2000平方米，库区内设施齐全。目前，经口岸向独联体、阿富汗、巴基斯坦等国和地区出口货物近5000多吨，货值达1.2亿美元。二类口岸依托的华凌市场占地350亩，规划总面积60万平方米，是一座融商贸、仓储、博展、娱乐、广告服务、信息功能于一体的大型综合市场，是西北最大的建筑装饰材料市场，国内经营和生产建筑、装饰材料著名厂家在市场设有经营点，品种达1万余种。市场内设有工商、税务、邮政、通讯、银行等服务部门，方便了中外客商的旅游购物。

昌吉亚中商贸城综合批发市场二类口岸
昌吉亚中商贸城综合批发市场二类口岸于2000年经自治区人民政府批准设立。口岸设在亚中商贸城综合批发市场内。市场位于昌吉市区内，毗邻 312国道，东距乌鲁木齐38公里，是乌鲁木齐通往北疆的咽喉。市场占地429亩，建筑面积20万平方米，规划有10000个营业摊位。口岸建有查验单位联合办公大楼、监管仓库，总建筑面积21000平方米。

喀什市中亚国际贸易市场二类口岸
喀什市中亚国际贸易市场口岸于2000年经自治区人民政府批准设立。

伊犁巴音岱二类口岸
伊犁巴音岱口岸于1993年经自治区人民政府批准伊犁州客运中心为国家二类口岸，同年5月，伊宁海关进驻二类口岸开展工作，随后各联检单位陆续设立办公机构。1994年4月，自治区口岸办批准该二类口岸开展出口货物的仓储和运输业务。为加大二类口岸的管理协调力度，创造宽松的通关环境，经自治区口岸办批准，1998年成立了口岸管理委员会。经过发展，口岸现有封闭式停车场13100平方米，涉外仓储库房5座，库房总面积达2271平方米，并配备检测仪器。到目前为止共完成出口货物 191万吨，货值4.8亿美元，运送旅客31万人次，运输周转量33234万公里。巴音岱口岸的发展，极大地促进和带动了伊犁州涉外运输事业的发展。
伊宁二类口岸
伊宁口岸是自治区人民政府批准的二类口岸，位于伊宁市西郊边境经济合作区内，距市中心三公里，环境优美，交通便利。伊宁口岸是 1993年正式对外开放，主要开展的贸易形式是旅游购物。据统计，伊宁口岸自开放以来，累计出境车辆达12030次，出口货物逾21.3万吨，货值22.38亿人民币。经过几年的发展，伊宁口岸逐步走向正规化、规范化、制度化的轨道，口岸贸易有了较大发展，基础设施完善。现有涉外运输货场三个，外籍车辆监护场一个，总占地面积48000多平方米，监管封闭库房面积13000平方米，还有涉外运输车辆100辆，直达哈萨克斯坦的阿拉木图市、奇姆肯特市、琼扎县三地进行客货运输。口岸设有海关、进出口商品检验检疫、涉外运输管理、口岸管理处等查验办事机构。

塔城国际边贸城二类口岸
塔城客运站口岸是1996年5月由上海海成物资联营等几家公司共同投资兴建的。1996年10月 3日自治区人民政府正式批准边贸商城为边民互市贸易点，1997年7月塔城海关批准边贸商城为海关监管仓库。 1994年开放的原塔城客运站二类口岸，后迁移到边贸商城，口岸委及有关查验单位也进驻边贸商城。商城作为塔城经济合作区贸易走廊的第一期工程，占地面积72亩，拥有海关监管仓库46间，2650千方米，倒装、散装、对装场地17000平方米，仓库1500平方米，地下保温库房2800平方米，摊位44间共1000平方米，停车场9000平方米，商城主体楼8880平方米，其中拥有客房60间，并有多项服务场所。

奎屯火车站二类口岸
奎屯火车站口岸于 1994年批准设立。